1、MINIML的数据大部分是经过标准化后的
2、表达量级不同不代表没有标准化,有可能是取了log和没有取log的区别
3、分析中视情况会取log2
下载MINIML包并用GEO转换器转换后,得到的同一个分子在不同的GSE数据集中的表达形式不同,开始以为是标准化和未标准化的区别,后来我在网站上均下载了他们的normalized的数据,发现他们的量级还是不一样。
问题:1.MINIML数据是不是直接下载的标准化后的数据?
2.为什么表达量级不一样?都是同一研究,难道用了不同方法转化?
3.分析中是否需要将几千的量级进行log2转化?