R语言中 两句话不应该写在一行
如果一定要写在一行 用英文分号间隔 ;
如:
> a = 1; b = 2
> a
[1] 1
> b
[1] 2
>
所以你那么分成两行 要么’up‘后面用 分号 ;
1、library(ggplot2)
2、biowolf<-read.table(file="uu.txt",header=TRUE,row.names = 1)
3、data$sig[(data$padj > 0.05|data$padj=="NA")|(data$logFC < 2)& data$logFC > -2] <- "no",data$sig[data$padj <= 0.05 & data$logFC >= 2] <- "up",data$sig[data$padj <= 0.05 & data$logFC <= -2] <- "down"
4、volcano<-ggplot(biowolf,aes(x= log2(foldchange), y=-1*log10(pvalues)))