TCGA分析求助

在TCGA上下载胰腺癌(PAAD)的转录数据,用的是GDC-client的方法,files文件是912个,case文件是178个,用代码处理寻找*.counts结尾文件后倒入到data­ in one 的文件夹中是182个,我想请教一下产生这个问题的原因是什么,再有就是我下一步用json文件的时候使用case.json还是file.json。

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

推荐使用 TCGA简易下载工具:教程如https://shengxin.ren/article/514

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