真的小白别嫌弃我~自学 手动下载geo数据,r语言转换成fastq,后面怎么继续?

真的小白别嫌弃我~自学RNA-seq的处理

 手动下载geo数据sra,

r语言转换成fastqattachments-2018-11-1F2kNNtW5bdefb531ab67.png后面怎么继续?

比如质控(正在学)

后面生成表达矩阵,在做差异分析?后面能用DEcenter吗?

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1 个回答

调研图

可以,只要输入数据是counts或FPKM或标准化后的都可以

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