用SangerBox的DECenter做表达差异分析的话,出现data are essentially constant表示有些基因在各个样本中的表达都为0或者某个其他常数,将该行删除(在各个样本中的表达都为某个常数,这样的基因也没意义)。或者随机将某一个加上一个很微小的量(如0.0000001),这样就可以正常进行统计检验,不会报错。
你好,我试着GEO数据转换后用GSEA分析,可是运行后提示GSEA运行错误,然后GSEA运行完成,但是在文件夹里看不到结果。
DEC里运行后是显示输出信息:b'ERROR : data are essentially constant \r\n'
错误信息:b'There were 50 or more warnings (use warnings() to see the first 50)\r\n'
运行完毕,你可以去查看结果啦!
请教这两个会是什么问题?