按照《实战：拿TCGA肝癌的RNA-Seq数据来做差异分析》一文的步骤，对fileID.tmp中筛选、分组并替换后，再使用简易TCGA下载工具 的合并文件功能进行合并，然后打开fileID.tmp文件，发现里面内容还是对fileID.tmp编辑之前的，试了2次都一样，合并矩阵里的数据，转置过来也并没有像帖子里说的，01在前，11在后
其实你是问如何分组的问题吧，可以不用费劲修改顺序，而用以下R代码进行分组：
group <- ifelse(as.numeric(substr(colnames(exprSet),14,15))>1,"normal","tumor")
你确定你保存了嘛，你编辑完保存之后使用文本打开看看到底有没有改好，然后再导入软件
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