各位老师,请问怎么用KEGG对共表达基因做KEGG通路富集呢?(试过DAVID,里面的结果不是很理想)

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2 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

DAVID结果不理想的话可以试试 R包clusterProfiler

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strings

如果是用基因集合做富集分析的话。


可以试试其他的富集工具:

1. 稳定更新的网页工具有:g:profiler,enrichr;

2. 稳定更新的R包有:clusterProfiler;

3. 付费工具往往有奇效:IPA、metacore。


tips:付费工具也可以免费试用的哦。

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