用count文件做的膀胱癌基因差异分析，然后想对差异基因再进行单基因分析时，下载的FPKM结果发现基因名都没有一致的怎么回事
从TCGA数据库GDC下载肺腺癌LUAD文件，但不知道如何区分哪些是癌，哪些是癌旁，希望前辈能指点一下。 这个问题本人先是网络检索过，看到一个答案说到： “举个样本例子给大家： TCGA-02-0001-01C-01D-0182-01 这个代码中，最重要...
我下载之后，第一列出现的是年龄信息，请问怎么查找对应的样本编号
用limma包进行筛选，没有筛选出来。
老师，您好，我想请您指导一下，tcga的临床资料中，表示患者随访结束后最终生存状态的是还是？
生信人工具盒里的TCGA下载小工具里下载的临床数据GSE编号是多少可以知道吗？
请问如何将TCGA某一肿瘤数据按照高氧化磷酸化和低氧化磷酸化将每个样本分类？
TCGA简易下载工具下载BCGSC miRNA profiling后合并成TXT文件，用归一化工具提示选择该矩阵TXT文件，但提示非TCGA数据，无法使用TPM转换，不知是什么原因？是不是miRNA不用做归一化处理啊？
针对没有某些基因生存分析结果的情况，老师回复是“ 有些基因的表达值存在离群值，建议做一下标准化再跑会好很多”，请问，标准化是用 数据归一化工具TPM吗？即使用了TPM归一化也没有结果，该如何处理这些基因的表达...
我翻看TCGA的RNAseq V2 pipeline，官方数据只有rsem值，你们提供的简易下载工具中却有htseq-count read count。我想问，你们是如何将rsem值转换为htseq-count read count？如果我想结合下载到的TCGA level3和自己测序得到的RNAseq数据进行差异分析...
老师你好，tcga批量生存时间计算，表达数据归一化后值比较大的指标，比如都是几十几百的，最后都算不出生存曲线，但是之平均在20以下的，都可以算出来，这是为啥