请问一下TCGA 下载的CNV数据如何找到对应的基因？如何进行下一步分析？有没有基于Windows系统的分析方法？
一、进行TCGA数据下载一个maf格式的mutation，接受中有mutect,muse,vanscan,somaticsniper，这四个文件有什么联系。下载的MAF文件可能有两种格式 ，可能是47列，或者120列，这个对后续分析有什么影响？ 二、进行TCGA数据下载后这个仅仅有...
1.下载下来数据后怎么知道哪些样本是癌的，哪些是正常组织的？这个分类文件哪里可以搞到？2.盒子里DECenter工具打开要安装R，可是我R早就安装了，为什么还是总打不开还提示安装？
用简易TCGA下载工具，clinicalFull出错，显示“合并提取所有临床随访信息出现错误，请检查文件”，已经重新试了文件下载流程等，还是这样，求问怎么办呢，谢谢谢谢
TCGA简易下载工具下单HTSeq FPKM数据是 TCGA RNA-seqV2吗
请问，为什么我提取了一些样本，以及一部分临床信息分别保存成xlsx格式，导入表达谱和临床信息都显示是乱码啊？谢谢你！
在TCGA上下载胰腺癌（PAAD）的转录数据，用的是GDC-client的方法，files文件是912个，case文件是178个，用代码处理寻找*.counts结尾文件后倒入到data in one 的文件夹中是182个，我想请教一下产生这个问题的原因是什么，再有就是我下...
老师，你好，请问用生信人软件下载的TCGA的CNV数据如何找到对应的基因？
我下载的Colon cope number variation(972)，成功下载后，总是合并失败，我重新下载了，再次尝试依然失败
哪位大神能解答下TCGA HT-seq count矩阵用quantil与Z-score标准化有啥区别，我是用的limma包处理的count矩阵，用的quantil标准化，如何用Z-score标准化怎么弄，求代码。
请问简易TCGA下载工具的ENSG_ID转换和TCGA ID转换器的转换有什么区别吗？
请问各位老师，下载了TCGA FPKM数据，准备用来做差异分析，生存分析，问题是：如何清洗数据，是根据 FPKM 平均表达值大于1吗？还是 FPKM数据进行TPM归一化后清洗，归一化后怎么清洗数据，请各位老师指导，困惑了很久不知...
1、感谢：我成功下载了“简易TCGA下载工具V2”。 2、但是，解压文件后，按照说明，双击“main”exe文件后 出现“图1”： 3、请问：如何解决问题？ 谢谢！