在tcga下载了rnaseq后，合并得到genecount，我经过id转换之后得到很多LNC或LOC开头的id名，在GEPIA里面查询不到这些基因的信息，全网搜索有些没结果有些则是mirna，而且这部分基因占比不小，我做了WGCNA之后模块里面也出现这些id，...
TCGA简易下载工具下载下来的CNV文件的sample名称该如何解读？ 我需要根据CNV的分析结果做survival分析，因为不知道sample名称是什么ID类型，该如何解读，所以没办法进行ID转换，将sampleID转换为TCGA的barcode。 因为所有的sample...
miRNA seq 还是 RNA seq呢，谢谢
...们，本人刚刚接触生信，想咨询一个可能很弱智的问题，tcga如何下载某一特定类型的肿瘤数据，我想下载一下口腔癌或者舌癌的数据，但是里面搜到的数据是头颈鳞癌，打开clinical数据不知如何筛选，，查到的数据BA，BB不知道...
如题。谢谢
问题已解决，一开始所有的的工具都打不开，只显示已开启，然后配置JAVA和R也不行，后来重新下了个清凉版的sanger box,再配置JAVA和R就成功了，yeah!
使用简易TCGA下载工具V8下载RNA_seq数据，合并后，进行ENSG_ID转换，产生两个文件Merge_matrix.txt.cv.lnc ，Merge_matrix.txt.cv ，请问分别包含什么类型RNA，Merge_matrix.txt.cv.lnc 是 仅含有lncRNA么，Merge_matrix.txt.cv是仅含有mRNA么。请指点，谢谢...
想从TCGA中下载急性髓细胞白血病，但好像标题中的两类文件都是急性髓细胞白血病，做分析的时候需要合并在一起吗？
按照《实战：拿TCGA肝癌的RNA-Seq数据来做差异分析》一文的步骤，对fileID.tmp中筛选、分组并替换后，再使用简易TCGA下载工具 的合并文件功能进行合并，然后打开fileID.tmp文件，发现里面内容还是对fileID.tmp编辑之前的，试了2次都...
RNA-seq数据下载下来如何筛选miRNA的数据
比如说这个文件，文件名是8f00---------------,下载到我电脑里的文件名就少了开头的8 这是怎么回事啊，怎么解决
您好，我想研究某一个lncRNA在某种中肿瘤中的表达情况，参考了这篇文章https://www.shengxin.ren/article/1，但是如果提取出来的是批量的基因，如何把我感兴趣的几个lncRNA提取出来，和临床病理资料做卡方，单因素，多因素分析呢，...
请问我今天向RTAC转了5元，还能购买TCGA临床病理资料详细解读吗？