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小白福音:TCGA突变瀑布图简易个性化绘制工具

...会选择瀑布图进行展示,瀑布图看起来十分的复杂高端,TCGA数据库中提供了近30种肿瘤的外显子测序数据,在这里我们开发了一个 个性化的工具 可以快速的展示指定基因在指定样本中的突变景观。 需求1、绘制某个肿瘤中的突...

TCGA下载的样本后面跟上rep是什么意思呢?可以删除这组数据吗?是指重复吗?

这些样本后面跟上rep是什么意思呢?前面有和它相同的样本,是指重复吗?不知道可不可以删除,原始数据里面是都有表达量的,还是说二者取平均值

想知道TCGA数据库下载的癌与正常组织has-miRNA的数值是如何计算来的?标准化处理的过程?

最近在处理数据,请师弟帮我从TCGA下载了所有肺癌患者的临床资料与has-miRNA的值,做统计的时候需要比较miRNA高低表达,但是不知道如何比较,所以想逆计算原始的数值。

TCGA下载小工具查不到GBM . Array-based Gene Expression (EXP-A)的数据,怎样可以下载啊?

如何使用TCGA数据库分析VASH1和miR143临床样本分析表达量的正相关或负相关

TCGA样本数据库里有乳腺癌分子分型的信息吧,我找半天没有找到,向各位大神请教一下,谢谢

解决 TCGA的miRNA数据,癌375个样本,癌旁50个样本,用limma做分析可以吗,会不会编辑要求必须要配对样本

TCGA下载工具 做miRNA什么分析下载BCGSC miRNA Profiling.isoform?什么分析下载BCGSC miRNA Profiling?谢谢!

TCGA数据下载完数据是这样的,还需要做标准化吗? 如果还需要标准化该选择哪种呢?感谢解答。

请问从TCGA下载manifest文件后,使用cmd运行gdc-client文件,为什么不能正常下载?出现如下提示?

解决 大家如何评价GPL570检测lncRNA表达呢,它的数据与TCGA数据比起来没有任何突出的优点吗?现在不能用了吗,望指点,谢谢!

...异lncRNA就只有100多个(ಥ_ಥ),然后询问是否可以转向使用TCGA数据,这样结果更令人信服。那我是不是就得用TCGA数据重新做?但是这样毕竟耗时间啊,改数据的话文章基本重做了,感觉改动好大啊。我不想改数据啊,大神们有没有...

解决 老师您好,想问下用贵公司盒子下载的TCGA的miRNA数据,如何合并得到read count数据(目前自动合并的是标化后的)?

老师您好,用贵公司的软件下载TCGA的miRNA数据,点击合并后自动得到标化数据的矩阵(reads_per_million_miRNA_mapped),现在想得到read count合并矩阵,该如何做呢?

解决 用DE-centerV4 edgr 分析TCGA数据 快三个小时,没结果也不显示失败,请问大家有什么办法呢?

TCGA数据批量生存分析点运行之后批量运行和导出结果按钮变成了灰色,这个问题您解决了吗,是哪里出了问题?

 

TCGA 胃癌数据,运行单基因的GSEA,最后看不到在运行,也未报错,但是等待很长时间,仍没有没有任何结果