TCGA下载工具下载的表达数据样本有后边跟着REP编号的，请问这是什么（不同阶段？重复试验？），应该怎么处理（删去？取均值？）？

比如结肠癌表达数据，其中的一个样本，这三个数据表达值不同

解决 请问TCGA数据中2种甲基化数据（MethyArray27K和MethyArray450K）有什么不同呀？并且后面的Liftover是什么意思呀？

用简易TCGA工具下载TARGET数据时，为什么clinical的数据和RNA数据不能匹配，每个样本的编号都对不上？

为什么在TCGA简易下载工具下载的mirna数据合并后找不到了，而且数据归一化不能选择多个数据的？

请问在TCGA数据库中点击miRNA-seq，然后在点击Exp下载数据，如下，但是下载的数据是基因表达数据吗？

请问在TCGA数据库中点击miRNA-seq，然后在点击Exp下载数据，如下，但是下载的数据是基因表达数据吗？

TCGA简易下载工具v14中的甲基化数据和CNV数据下载后，都是转化好的基因水平的矩阵吗

做差异分析应该选择下载图中哪种类型的数据?

解决 TCGA简易下载工具的临床随访数据中Clinical BCR Biotab,Clinical BCR XML,Clinical BCR OMF XML分别代表什么意思

请问一下TCGA简易下载工具的临床随访数据中Clinical BCR Biotab,Clinical BCR XML,Clinical BCR OMF XML分别代表什么意思？ 另外下载了这些临床数据，合并文件后得到的文本，例如Clinical BCR XML.merge的一个文件里头为什么只有都是肿瘤的数据...

用TCGA简易下载工具下载LAML下的RNA Seq counts每次下载下来都是零，是怎么回事？别的疾病下面就没有这个问题

用limma包做tcga数据差异分析，应该用下图中的哪个数据？是用标准化后的还是原始数据？如果做生存分析呢？

TCGA简易下载工具下载FPKM 数据时总显示下载出错，请重新下载怎么办？半夜也试过了，还是下不下来，求解

简易TCGA下载工具使用教程

第一步，在左侧癌症列表中双击选择所需下载的癌症类型第二步，选择需要下载的样本类型，默认选择原发癌和癌旁正常组织，根据需要单击选择所需样本类型，当所有样本类型均不选则下载所有的样本类型 第三步，单击重...

解决 为什么工具下载的TCGA RNA-seq 以及 miRNA-seq 只有癌症样本，而没有正常样本

但是甲基化数据以及CNV数据是2种类别的样本都有。 这样的话RNA以及miRNA的数据就没法做机器学习的相关分析了呀。 如何找到RNA miRNA的正常样本的数据呢？

TCGA下载的GBM数据中哪3个文件是somatic mutation，CNV和gene expression，如何把前两者转换成0-1矩阵

用TCGA简易下载工具下载TARGET的相关数据时，为什么clinical的编号和RNA的对应不上，每个样本的编号都不同？