简易TCGA下载工具v8版本 修改tmp后，点击合并文件无反应
TCGA下载的临床数据，想做生存分析KM曲线，在提取Overall Survival时我一直以为days to last followup的数据就是OS的时间，但看了网站上的帖子说OS的时间应该为days to death和days to last followup合并后的时间，不知到底哪种算法正确？谢谢！
求大神解答，用TCGA做了WGCNA后，想将某一模块做生存分析？模块一份为二后的生存时间，生存状态怎么算？如何生存分析？
用DECenter分析差异基因时，报错提示row.name有重复，我查重第一行TCGA编号，没发现有，要怎么处理呢？感谢各位老师！
sanger1.0.5版，win10系统，存放于D盘根目录下，想打开TCGA建议下载工具，提示“启动完成”，但没出现软件的界面。
想要分析从TCGA上下载下来的counts数据，得到差异表达，但是按照生信人推送的教程操作后，用DECenter分析差异数据的这一步总是出现如图所示的说样本列有重复，要怎么解决啊？我已经对过了，keys这一栏没有重复的序号。
请教大神： 1、生信工具盒启动tcga数据下载，其中可下载资源选择哪一种，癌与癌旁分开下载还是合并文件下载。 2、下载的数据怎样用decenter分析出差异基因（类似于下面截图中的数据格式），用于进一步的分析。
老师们好，我想问从TCGA下载下来的miRNA是否还需要标准化？目的是差异分析和生存分析 mRNA.lncRNA应用简易数据标准化工具有4种标准化方法的； 那么，他们3种RNA是否需要一样 的标准化方法？目的是生存分析
工具盒里最新的V5 DECenter分析报错，不太看的懂什么问题，都是按教程走的，下的TCGA的rna count数据，合并了矩阵，做了样本分组表，分析到一半出现这个
运用DEcenter分析TCGA数据，选用limma（芯片）方法分析可以得到结果，但选用edgR（counts数据）结果显示：ERROR : 无法分配大小为86.2 Mb的矢量 ，再选用DESeq2（counts数据）结果显示：Warning messages: 1: 程辑包'GenomicRanges'是用R版本3.4.2 来...
...次研究中，Wouter Hendrickx等人为克服这个缺陷，他们整合TCGA数据库中乳腺癌病人的拷贝数（CNV）、体细胞突变（somatic mutation）以及基因表达谱数据（RNA-seq），首先，基于1004个乳腺癌病人的RNA-seq表达谱数据，通过之前研究报道与...
...Data Portal (https://dcc.icgc.org/) 最全的癌症项目数据库，包含TCGA的数据 COSMIC (http://cancer.sanger.ac.uk/cosmic) 人工注释癌症样本中的Somantic Mutation大全 BioMart (https://www.ensembl.org/biomart/martview/1fbe827446e53d1a0f34002043ac4dfa) 在线注释基因组信息...
tcga下载数据，合并文件，通过ID便携转换，为什么需要转换的有60488，转换成功的有19814呢？转换导出的时候很久没有弹出转换完成，任务处理器关闭的时候显示转换完成，但是数据一定是没有下载全的，我要继续等么
在TCGA下载工具获得数据并转化成TPM 文件后（Merge_Matrix.TPM），需要进行ID转化，但将上述的文件在便捷ID转化中总是出现图片所示的问题，请问如何处理？