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limma包是2015年发表在Nucleic Acids Resarch一个做差异分析的工具,目前引用次数高达七千多次。Limma包是基于voom的算法,它既可以对芯片数据进行差异分析,也可以对转录组高通量测序数据进行差异分析。
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肿瘤微环境是肿瘤组织或细胞所处的细胞环境,它由免疫细胞,间充质细胞,内皮细胞,具有炎症介质和细胞外基质(ECM)分子[1-2]。在肿瘤微环境中,免疫和基质细胞是两种主要类型的非肿瘤组分,并且已被证实对于肿瘤的诊断和预后评估具有很大价值[3]。
《TCGA数据下载的终极篇》