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QIIME2是微生物组分析流程QIIME(截止17.9.10被引8335次)的全新版(不是升级版),采用python3全新编写,并于2018年1月全面接档QIIME,是代表末来的分析方法标准(大牛们制定方法标准,我们跟着用就好了)
QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology)是一个专门针对于微生物群落的分析pipline,可以进行OTU,以及多样性分析等等。拥有处理16s rRNA所需要的软件并呈现相应的处理结果。所谓分析pipline必是集成软件,QIIME也不例外。因此安装起来超级麻烦。