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闲暇时突然想写一个GO富集分析的小工具,说到富集分析的话不得不提Y叔的clusterProfiler了,简单的使用clusterProfiler提供的GO富集分析的例子: ## Not run: data(geneList)de <- name...
在现在的组学研究中几乎离不开GO分析,那么GO是干什么的呢,GO的诞生主要目的是来归类 统一生物学方言的(不同的生物学数据库可能会使用不同的术语),它是一个有向无环图(DAG)本体,主要形式是一term标记,每个GO term代表一种功能描述,都属于ontology,而GO总共分成三个ontology:molecular function, cellular component和biological process