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NCBI于2000年发起的基因表达汇编(GEO)计划。致力于建立一个基因表达数据仓库和在线资源,用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。 GEO主要包含各种芯片数据,也有少部分测序数据,
TCGA、GEO、GSEA富集分析套路解析!
GEO是目前常用的数据库中收纳数据量最为全面的数据库之一,我们本次基于GEO数据开展一篇生信类型的文章,进行解读、复现、拓展三个方面的解析。 我们本次的总是就是PC端做生信,实现零...
本节课主要讲解数据标准化,基于我们上一讲的数据预处理中使用RMA工具提取基因表达普数据,重现文章中的标准化结果,以及零代码实现标准化数据和箱线图绘制工具使用说明。 1、本节所讲内容如...
一套万金油GEO数据处理方式,对于下载Series Matrix File和MINiML formatted famliy file文件信息解读和便捷处理方法,绝对是分析新手的制胜法宝。 1、万金油处理思路; 2、Series Matrix F...
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