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热图(heatmap)是分子生物学文章里(尤其是microarray, RNA-seq相关论文)经常出现的图片,热图可以: 1)直观呈现多样本多个基因的全局表达量变化; 2)呈现多样本或多基因表达量的聚类关系...
这么优秀的热图,只需要10秒,你信吗?
文章投稿,除了文好当然还要“颜好”!在这个看脸的世界,为了给文章加分,各位老师学生也是做足功课了!但是不会编程敲代码?——那必须学学各种绘图小工具了。
那么数据预处理、数据标准化都已搞定,接下来进入数据分析阶段,那么本节主要怎么通过sangerbox中的DEcenter进行差异分析、根据差异分析结果使用火山图工具以及热图绘制工具。 1、首先让我们看...
研究基因功能的人建个树,需要找近缘物种、外类群十几至几十个物种,费N天的劲才能做个树。而宏基因组领域的人不用去收集其它物种,因为研究的对像本身就有几百到几千的物种,为了方便阅读或展示主要信息,我们反而会挑选结果中前100以内的物种去分析并展示。这是我们绝对的优势。
如何利用生信人工具把坑踩完,完成筛选差异。
利用转录组数据研究丹参的抗旱机制。