GEO芯片数据转换器使用说明

随着微阵列芯片技术尤其是基因芯片的广泛应用,产生了海量的数据,为基因研究提供了大量的高通量数据资料,而GEO数据库就是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。用户不仅可以上传自己的数...

随着微阵列芯片技术尤其是基因芯片的广泛应用,产生了海量的数据,为基因研究提供了大量的高通量数据资料,而GEO数据库就是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。用户不仅可以上传自己的数据,而且还可以免费下载数据库中和自己研究方向类似甚至相同的数据来进行分析,为自己的研究提供一些启示或者验证。

目前GEO数据库提供的下载主要有两种方式:

一、原始数据下载

二、处理好的矩阵下载

以上两种方式下载的数据都不能一步到位到后续的分析中,GEO芯片数据转换器旨在提供一个一步到位的方法将提取GEO芯片数据的样本信息和基因表达数据,工具视图如下:

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从图中可以看出,界面极其简洁,一看就会。

step1:导入下载好的数据

step2:点击导出样本信息

step3:选择要转换的ID(比如探针转换gene symbol),选择需要提取的数据列

step4:导出数据矩阵



  • 发表于 2017-08-10 10:36
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  • 分类:软件工具

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