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在数据分析过程中必然会面临两种问题,一种数据 数据存在缺失,一种是数据没有标准化,在这里我们提供了 一个简易的一体化的工具用于处理数据缺失补全和数据标准化。
界面如下:
工具界面非常简单,结果和非常简单,如下:
缺失值补全写作:
首先我们获取了表达矩阵,去除了NA值比例大于X%的行(基因)和NA值比例大于Y%的列(样本),更进一步的利用R软件包impute的impute.knn函数进行缺失值补全,设置Number of neighbors 为 K以补全数据缺失。
数据标准化部分写作:
更进一步的我们对数据进行了【分位数标准化、中位数标准化、log2转换,行Z-score转换,列Z-score转换,行和列Z-score转换
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