TCGA下载工具V12用教程
由于TCGA下载工具之前的版本中用户无法连接TCGA时无法下载，也无法支持GEO数据下载，本次升级将对上述的两个问题进行解决
号外！号外！TCGA下载工具V12的升级版本上线啦，以后将在SangerBox中更新啦！！
首先我们登陆SangerBox -> 其他 -> 生信人VPN定制化客户端（详细操作见下面链接）
目前依本版无法支持GEO数据下载，简单界面如下：
首打开这个软件界面是这样的：
之前因为我电脑无法访问TCGA，所以左侧就刷不出来，不过现在由于我们之前已经提前打开VPN，所以直接检索完成：
与之前老版本相比，本次的便捷之处在于检索前已经对数据分类：
比如我们只检索甲基化数据，检索速度更快，没有其他干扰，美美哒！！
最后合并步骤没有变化，我们使用之前的TCGA-LIHC为例如下：
下载完成后选择合并文件：
假设我们要下载GSE1234,如下图操作：
V13版TCGA,在兼容性和内存使用上都有较大的提升，请尽量使用新版，当然乳腺癌一千多个样本的合并，这个版本的做了特殊的优化，或许可行。
- 发表于 2017-11-09 16:05
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- 分类：软件工具
