数据挖掘系列二开篇如何构建CeRNA
TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本讲非常详细解读基本TCGA数据库为后续分析打下一个坚实基础。
大家好，我们的新的一期数据挖掘系列出炉喽
ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。
TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类。
那么这么多的数据如何下载，下载后怎么不用写代码分析呢？那么接下来的视频进行揭晓
1、多种TCGA数据下载及处理
2、TCGA数据可以介绍
3、临床数据下载介绍（临床数据解读见TCGA临床信息解读）
4、TCGA数据库中RNA Seq数据三种数据类型的区别，注释信息版本等解读
5、TCGA数据库中miRNA、甲基化数据解读
6、TCGA数据库中样本命名规则，已经由很多小伙伴在社区问过这个问题
7、数据下载方式比对
8、简易TCGA下载工具操作说明，简单、方便、快速，零代码实现
基础知识介绍完毕，下一讲将开始讲解开始分析的第一步，数据准备和预处理
- 发表于 2018-11-16 11:14
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- 分类：基因组学
