数据挖掘系列二开篇如何构建CeRNA

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所(NCI)及国家人类基因组研究所(NHGRI)联合建立,其包含丰富的肿瘤数据类;ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本讲非常详细解读基本TCGA数据库为后续分析打下一个坚实基础。

大家好,我们的新的一期数据挖掘系列出炉喽

ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所(NCI)及国家人类基因组研究所(NHGRI)联合建立,其包含丰富的肿瘤数据类。

那么这么多的数据如何下载,下载后怎么不用写代码分析呢?那么接下来的视频进行揭晓

1、多种TCGA数据下载及处理

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2、TCGA数据可以介绍

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3、临床数据下载介绍(临床数据解读见TCGA临床信息解读

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4、TCGA数据库中RNA Seq数据三种数据类型的区别,注释信息版本等解读

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5、TCGA数据库中miRNA、甲基化数据解读

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6、TCGA数据库中样本命名规则,已经由很多小伙伴在社区问过这个问题

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7、数据下载方式比对

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8、简易TCGA下载工具操作说明,简单、方便、快速,零代码实现

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基础知识介绍完毕,下一讲将开始讲解开始分析的第一步,数据准备和预处理


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#103

  • 发表于 2018-11-16 11:14
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  • 分类:基因组学

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