零代码系列之三教你如何做WGCNA开篇复现文章解析

最近在写工具盒里WGCNA工具的使用教程,检索素材时发现了一篇文章,哦不,是两篇,他们长的几乎一样但是分数却相差近三倍,我们的目的就是零代码完美复现1、数据采用GEO公开数据集;2、老思路,通过sangerbox中的DEcenter来实现差异基因筛选,想必大家已经并不陌生;3、重头戏,sangerbox中的一键式WGCNA分析使用以及讲解老师的个人经验分享;4、结合临床信息筛选关键模块,通过万能的excel实现;5、hub基因筛选,以及预后相关性,在线网站统统搞定;6、最后就是外部数据验证。

我们前段时间也在社区里面解读两篇WGCNA的文章,这里面是只有一字之差影响因子却相差3倍,具体可见,这里我们就不再耽误大家宝贵时间。

首先是我们主讲老师对于这篇4.4分的文章进行解读

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1、数据采用GEO公开数据集

2、老思路,通过sangerbox中的DEcenter来实现差异基因筛选,想必大家已经并不陌生

3、重头戏,sangerbox中的一键式WGCNA分析使用以及讲解老师的个人经验分享

4、结合临床信息筛选关键模块,通过万能的excel实现

5、hub基因筛选,以及预后相关性,在线网站统统搞定

6、最后就是外部数据验证

这里就是文章大致流程,它的流程图也可以看下张图

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讲解老师认真的解读文章,这里肯定会让你有意想不到的收获

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只是能做还是不够的,还要会看懂数据和结果

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最后再来一张接下来我们要做的内容

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下一节课就会进入文章的复现阶段,请各位小伙伴认真听讲哦


#161

  • 发表于 2018-12-10 14:56
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  • 分类:软件工具

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