胶质瘤免疫治疗高分文章赏析
首先祝大家圣诞节快乐！
今天不废话直接看文章。
一篇来自发表于神经医学一线期刊《Neurology》（IF=7.609）的文章。
（在本公众号输入 30171077 可下载该文章全文预览)
胶质瘤是成人中最普遍且具有毁灭性的原发性脑肿瘤，目前只有15个月的中位生存时间，目前已有大量的研究发现胶质瘤与免疫之间存在关系。
靶向PD1 / PD-L1疗法在过去十年中已经被广泛应用，旨在恢复肿瘤中的免疫活性，但不同肿瘤的反应率不一致。
到目前为止，我们未能在胶质瘤整个grade中找到关于PD-L1表达的单一综合报告。只有一项研究由Nduom等人提出的胶质母细胞瘤中PD-L1的表达其占胶质瘤的约40％。
为了综合的研究PD1表达和临床特征，我们使用了TCGA和CGGA的RNA-Seq数据和临床数据，本次研究是首次综合的分析胶质瘤的PD-L1表达的分子和临床特征。
Cortez et al等人发现TP53通过microRNA-34调节PD-L1表达的新机制，从而助于肿瘤的免疫逃避，因此我们将 TP53,PD-L1, PD1, CD80, PD-L2 放在一起分析。分别计算了这五个基因之间的皮尔森相关性如A-D所示，从中可以看出在所有的脑瘤中(A)PD1, PD-L2, and CD80之间存在很高的相关性，这提示了PD1通路的激活。而胶质母细胞瘤相比较低级别的胶质瘤诱发更高的炎症和免疫反应，故我们将GBM的单独拿出来做了一下如B图，从中可以看出他们的相关性更高了。同时在TCGA中亦如此如C\D图，以上的结果表明这些分子他们之间是协同作用的，而TP53相关性较低可能是由于数据噪音造成的。
已有很多报道表明在胶质瘤中的表达异常的基因比如B7-H3, B7-H4, LAG-3, and TIM-3，我们也将这些基因放在一起分析。分别计算了这这些基因及PD-L1之间的皮尔森相关性如A-D所示，从中可以看出大部分基因的表达与PD-L1存在正相关的关系。
讨论
本文通过从PD-L1的表达入手整合TCGA、CGGA数据：
1、从明星分子IDH1突变上发现了不同的突变状态与PD-L1的表达存在相关。
2、从不同的Grade样本中发现他们的PD-L1的表达也存在明显的差异
3、从不同的分子亚型入手发现PD-L1的表达也有明显的特征，尤其是在间充性亚型中，PD-L1可能作为一个标志物。
4、从胶质瘤已研究的相关的诊断分子和PD-L1相关的分子的表达与PD-L1的表达相关性出发，发现这些分子存在一定的协同作用
5、根据基因的共表达关系筛选与PD-L1共表达的基因来推测PD-L1可能参与的生物学途径，分析PD-L1的潜在功能。
6、根据已报道的炎症相关的基因来分析PD-L1的表达与炎症的关系。
7、根据病人的预后信息来分析PD-L1的预后关系。
本文结合了肿瘤免疫、单基因的表达分析策略来阐述了这样的一个故事，其中单基因分析策略和肿瘤免疫都是值得借鉴的。
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- 发表于 2018-12-26 14:13
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- 分类：文献解读
