张海伦
张海伦 - 生物信息分析员

性别: 北京 - 北京市 注册于 2017-03-24

生物信息专业毕业,专注生物信息行业,对基因组学,转录组学有所涉猎,欢迎大家相互学习。

向TA求助
130金币数
1010 经验值
42个粉丝
主页被访问 14262 次,0,

50 个回答

0 赞同

如何进行病毒序列进化分析

我给你推荐一篇文章吧。这个文章写得超级详细。http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fpls.2016.01400/pdf 题目:Genome-Wide Identification, Evolution, and Co-expression Network Analysis of Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinases inBrachypodium distachyon

回答于 2017-08-17 20:44

0 赞同

六框翻译

推荐gffread

回答于 2017-08-11 17:34

0 赞同

做变异检测时,如何产生VCF4.0版本的,为什么GATK产生的都是4.1版...

VCF4.0 跟VCF4.1我觉得没有多大区别,可能他输出结果不友好,但可以编程去操作。纠结这些细节没有太大意义。

回答于 2017-08-11 16:59

0 赞同

bowtie跑colorspace出现的错误

是不是read 质量值编码有问题啊。你瞄下。

回答于 2017-08-10 09:03

0 赞同

求大神指导怎么操作,稍微具体点

IGV软件主要用于基因组展示的。像你说的这个,就是观察染色体缺失和扩增情况的。 一个看CNV变化的文章,你参考下。https://www.shengxin.ren/article/98

回答于 2017-08-07 16:14

1 赞同

Python处理如何将相同基因的FPKM算一个平均值再输出

构建两个字典。第一个字典存基因出现的次数。第二个字典基因出现的FPKM总和。 然后遍历整个字典。输出基因和相应的值。

回答于 2017-08-03 20:15

0 赞同

RNAseq数据经过hisat2、stringtie处理后的如何得到一张如下格式...

你这个表格是芯片的表格哦,亲。RNA-seq转录组处理完之后的,需要编程处理得到这样的表格。

回答于 2017-08-03 20:13

0 赞同

关于MeV做热图

这个是基于java开发的,又有可能是因为你没有安装jre,你可以按照软件提示去下载安装。当然你也可以利用这个软件的在线版,http://www.tm4.org/#/welcome。 除此之外,还有很多在线绘制热图的工具。如http://www.chibi.ubc.ca/matrix2png/

回答于 2017-08-03 13:26

0 赞同

如何获取生育情况,体重指数等信息

https://www.shengxin.ren/article/96

回答于 2017-08-01 16:13

0 赞同

各位老师,转换ID前的ENSG有6万多,转换后mRNA2万多,lnc一万多...

ENSG 6万多,转换之后的mRNA只有2万多,你确定吗。这个mRNA是基因还是转录组啊。如果是基因可以理解,如果是转录本,那小编就特别不理解啦。还有就是,你研究的是人,还是其他物种。

回答于 2017-07-31 10:50