我给你推荐一篇文章吧。这个文章写得超级详细。http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fpls.2016.01400/pdf 题目:Genome-Wide Identification, Evolution, and Co-expression Network Analysis of Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinases inBrachypodium distachyon
回答于 2017-08-17 20:44
VCF4.0 跟VCF4.1我觉得没有多大区别,可能他输出结果不友好,但可以编程去操作。纠结这些细节没有太大意义。
回答于 2017-08-11 16:59
IGV软件主要用于基因组展示的。像你说的这个,就是观察染色体缺失和扩增情况的。 一个看CNV变化的文章,你参考下。https://www.shengxin.ren/article/98
回答于 2017-08-07 16:14
构建两个字典。第一个字典存基因出现的次数。第二个字典基因出现的FPKM总和。 然后遍历整个字典。输出基因和相应的值。
回答于 2017-08-03 20:15
你这个表格是芯片的表格哦,亲。RNA-seq转录组处理完之后的,需要编程处理得到这样的表格。
回答于 2017-08-03 20:13
这个是基于java开发的,又有可能是因为你没有安装jre,你可以按照软件提示去下载安装。当然你也可以利用这个软件的在线版,http://www.tm4.org/#/welcome。 除此之外,还有很多在线绘制热图的工具。如http://www.chibi.ubc.ca/matrix2png/
回答于 2017-08-03 13:26
ENSG 6万多,转换之后的mRNA只有2万多,你确定吗。这个mRNA是基因还是转录组啊。如果是基因可以理解,如果是转录本,那小编就特别不理解啦。还有就是,你研究的是人,还是其他物种。
回答于 2017-07-31 10:50