张海伦的回答

张海伦 - 生物信息分析员

生物信息专业毕业，专注生物信息行业，对基因组学，转录组学有所涉猎，欢迎大家相互学习。

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TCGA简易工具下载数据视频教学版能再发一次么

视频之前上传到了腾讯视频生信人TCGA数据下载工具

回答于 2017-12-11 19:05

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如何调整此平台发布文章中图片的布局

选中图片，下方会有一个显示图片比例的按钮

回答于 2017-12-08 08:58

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请问大神有没有limma包对txt文件筛选差异基因的代码，不胜感激！

生信人小工具就可以。

回答于 2017-12-08 08:58

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GEO芯片数据转换器

小工具统一归笼到了工具盒中了，请看这里：https://www.shengxin.ren/article/222

回答于 2017-11-09 16:33

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GEO芯片转换器

http://gap.shengxin.ren/tool/8/#

回答于 2017-11-09 16:33

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用DECentre老是闪退，导入矩阵数据后就出现程序停止运行

数据截图，发下，看看。

回答于 2017-11-07 14:42

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用批量生存分析工具做生存分析

这个可能是因为数据量有点大。你是不是可以先做差异，把差异的基因筛选出来，再去做生存分析呢。

回答于 2017-11-03 12:51

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GEO中GPL2507平台，没有genesymbol和ID信息，这样的怎么处理可以...

GPL2507平台样本信息 IDtarget IDSequenceSourceSource of the target sequence accessionGB_ACCRefSeq identifierAnnotation DateDate of build of sequence source (for UniGene and Gnomon)SPOT_IDUniGene, Gnomon and control sequences 确实没有提供gene symbol 但是提供的GB_ACC 。和SPOT_ID 建议，先利用这两个id...

回答于 2017-10-30 14:32

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请问：您有统计基因组序列信息的脚本吗？比如得到它的n50， gc...

你好，首先感谢邀请。这个处理基因组序列的脚本，是perl R还是python 呢。这个N50 GC含量还是挺好做的。GC含量生信人的小工具就可以做。这个覆盖度，就得需要通过read和基因组去比对获取吧。这个脚本就麻烦了。如果有定制化需求，可以找我，定制化开发。祝好。

回答于 2017-10-27 15:01

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换了个数据下载，也更改了导出路径，还是不行，一直报错。

错误中提示，无法切换目录。建议改成英文路径测试下。

回答于 2017-10-25 09:35