张海伦
张海伦 - 生物信息分析员

性别: 北京 - 北京市 注册于 2017-03-24

生物信息专业毕业,专注生物信息行业,对基因组学,转录组学有所涉猎,欢迎大家相互学习。

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根据芯片筛选出的差异基因绘制其染色体定位分析图

这个不是有软件可以做了吗

回答于 2017-10-24 15:47

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已知拟南芥纤维素合成酶有9个成员,如何找出莲中有多少个成员,...

你好。这种分析一般比较传统,可以参考生信人关于基因家族分析套路(可以网上搜,百度文库有其他人上传的生信人的资料)。 通常的办法 1、将这拟南芥和莲的全部基因都下载下来(存在多个转录本的,选择最长的转录本)。 2、通过orthmcl对拟南芥和莲进行基因家族聚类。 3、挑选跟这9个基因聚在一起的莲中的家族。 4、将...

回答于 2017-10-24 15:44

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批量生存分析软件运行后数据缺失问题

不清楚,你原始数据哪里下载的,TCGA中的数据有A基因,原始数据是是否有。如果有看看是否有缺失值啥的。最好能多给些信息。

回答于 2017-10-24 15:30

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可是还是会一直提示没有匹配样本,数据已经检查过了,是有匹配的...

貌似应该是这样的问题吧。 以生存分析为例: 报错如下: 我首先看到报错提示说样本不匹配。 然后我就去一个个的对样本了。因为担心这个临床数据中的样本跟表达数据的不一样。 然后发现是一个大坑,完全对的上。然后我又制作了一个demo数据,样本数完全对的上。 然后还是跑不了,还是报错“样本不匹配”。 真是日了...

回答于 2017-10-24 15:28

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DECenter

为啥没看到截图,麻烦放下截图,谢谢。

回答于 2017-10-24 15:25

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DECenter

大哥 啥问题。      

回答于 2017-10-23 11:28

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运行DECenter出错,求指导!

文件有空行吧。请新建一个文件夹进行操作。

回答于 2017-10-14 16:30

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运行DECenter出错,求指导!

文件有空行吧。请新建一个文件夹进行操作。

回答于 2017-10-14 16:30

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从GEO下载下来的数据,用数据转换器生成样本信息和数据矩阵,就...

恩恩。今天我会搞一个文档,教大家如何从GEO数据下载,转化,然后使用筛选差异。 文章小白做差异:https://www.shengxin.ren/article/187

回答于 2017-10-13 09:15

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如何做好病毒的同源进化分析?

这个感觉不是一个问题,更像是一个课题啊。如何做好病毒的同源进化分析,首先你用的是什么技术。是全基因组测序吗。 如果是全基因组测序,首先的问题你基因组组装的要完整。最好是ogap,然后就是构建进化关系的时候,你用的是单个基因还是全基因组的one copy 基因呢。这里基因注释的好坏影响也很大。然后就是构建进化树这...

回答于 2017-08-23 11:02