你好。这种分析一般比较传统,可以参考生信人关于基因家族分析套路(可以网上搜,百度文库有其他人上传的生信人的资料)。 通常的办法 1、将这拟南芥和莲的全部基因都下载下来(存在多个转录本的,选择最长的转录本)。 2、通过orthmcl对拟南芥和莲进行基因家族聚类。 3、挑选跟这9个基因聚在一起的莲中的家族。 4、将...
回答于 2017-10-24 15:44
貌似应该是这样的问题吧。 以生存分析为例: 报错如下: 我首先看到报错提示说样本不匹配。 然后我就去一个个的对样本了。因为担心这个临床数据中的样本跟表达数据的不一样。 然后发现是一个大坑,完全对的上。然后我又制作了一个demo数据,样本数完全对的上。 然后还是跑不了,还是报错“样本不匹配”。 真是日了...
回答于 2017-10-24 15:28
恩恩。今天我会搞一个文档,教大家如何从GEO数据下载,转化,然后使用筛选差异。 文章小白做差异:https://www.shengxin.ren/article/187
回答于 2017-10-13 09:15
这个感觉不是一个问题,更像是一个课题啊。如何做好病毒的同源进化分析,首先你用的是什么技术。是全基因组测序吗。 如果是全基因组测序,首先的问题你基因组组装的要完整。最好是ogap,然后就是构建进化关系的时候,你用的是单个基因还是全基因组的one copy 基因呢。这里基因注释的好坏影响也很大。然后就是构建进化树这...
回答于 2017-08-23 11:02