刘永鑫
刘永鑫 - 工程师

性别: 北京 - 北京市 注册于 2017-10-12

十年生信经验,目前主攻宏基因组方向。中科院博后并留所工作,《宏基因组》公众号创建人。

向TA求助
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如果从宏基因组中对某一个细菌的基因做PCR富集,引物应该怎样设...

问题描述不清,你是要扩增16S吗,还是什么。宏基因组能分清某一细菌吗?

回答于 2017-12-18 23:09

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GEO芯片的探针名字 hp_hsa-mir-144 中的 hp_ 是什么意思?

管他干啥,知道又有什么意义呢。

回答于 2017-10-29 15:09

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有参转录组软件求助

这么旧的数据别用了,和现在的数据比起来,系统差异还是非常大的。

回答于 2017-10-28 09:56

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请问:您有统计基因组序列信息的脚本吗?比如得到它的n50, gc...

如果是自己分析的,基本信息软件都会提供的,如soap denovo,如果自己不够专业,基因拼接水很深,需要根据物种特征制定策略,建议还是找专业人士,比如楼上。

回答于 2017-10-28 09:53

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请教16S高通量测序结果分析流程

关注“宏基因组”公众号,里面扩增子、宏基因组分析流程都有。

回答于 2017-10-28 09:51

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下来来了文件,程序却不识别,求助

下载的文件是经常容易出错的,特别是长时间下载。建议重新下载。最好文件有md5值比对,是否下载正确。

回答于 2017-10-26 14:21

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DEcenter报错,代码如下,附上分析的数据文件

还是要提前数据筛选,清洗干净再用R分析。

回答于 2017-10-26 14:20

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转换ID的列只有这两个,请问是什么原因啊?

没有原因,就两个选项,可以都试试。

回答于 2017-10-26 14:16

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简易tcga下载工具

文章都是要提供测序数据NCBI/EBI SRA数据编号的。

回答于 2017-10-26 14:14

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有扩增子的详细视频教程吗?

扩展1:中文扩增子分析视频教程-夯实分析思路 ​ [扩展1:中文扩增子分析视频教程-夯实分析思路](http://mp.weixin.qq.com/s/SxWl0qBJgg8ziZUFDmKvpQ)  分为50讲,目前已经有34讲,非常适合学习。

回答于 2017-10-26 14:08