刘永鑫
刘永鑫 - 工程师
性别： 北京 - 北京市 注册于 2017-10-12

十年生信经验，目前主攻宏基因组方向。中科院博后并留所工作，《宏基因组》公众号创建人。

向TA求助
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10 个回答

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如果从宏基因组中对某一个细菌的基因做PCR富集，引物应该怎样设...

问题描述不清，你是要扩增16S吗，还是什么。宏基因组能分清某一细菌吗？

回答于 2017-12-18 23:09

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GEO芯片的探针名字 hp_hsa-mir-144 中的 hp_ 是什么意思？

管他干啥，知道又有什么意义呢。

回答于 2017-10-29 15:09

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有参转录组软件求助

这么旧的数据别用了，和现在的数据比起来，系统差异还是非常大的。

回答于 2017-10-28 09:56

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请问：您有统计基因组序列信息的脚本吗？比如得到它的n50， gc...

如果是自己分析的，基本信息软件都会提供的，如soap denovo，如果自己不够专业，基因拼接水很深，需要根据物种特征制定策略，建议还是找专业人士，比如楼上。

回答于 2017-10-28 09:53

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请教16S高通量测序结果分析流程

关注“宏基因组”公众号，里面扩增子、宏基因组分析流程都有。

回答于 2017-10-28 09:51

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下来来了文件，程序却不识别，求助

下载的文件是经常容易出错的，特别是长时间下载。建议重新下载。最好文件有md5值比对，是否下载正确。

回答于 2017-10-26 14:21

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DEcenter报错，代码如下，附上分析的数据文件

还是要提前数据筛选，清洗干净再用R分析。

回答于 2017-10-26 14:20

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转换ID的列只有这两个，请问是什么原因啊？

没有原因，就两个选项，可以都试试。

回答于 2017-10-26 14:16

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简易tcga下载工具

文章都是要提供测序数据NCBI/EBI SRA数据编号的。

回答于 2017-10-26 14:14

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有扩增子的详细视频教程吗？

扩展1：中文扩增子分析视频教程-夯实分析思路 ​ [扩展1：中文扩增子分析视频教程-夯实分析思路](http://mp.weixin.qq.com/s/SxWl0qBJgg8ziZUFDmKvpQ)  分为50讲，目前已经有34讲，非常适合学习。

回答于 2017-10-26 14:08