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510 个回答

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求助TCGA生存数据提取的perl脚本

何必如此麻烦,使用工具盒中TCGA下载工具包含下载、合并功能

回答于 2019-03-07 16:24

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请问在TCGA下载的miRNA数据中hsa-mir-21怎么转换为相应的基因名...

has-mir-21应该已经是miRBase命名,如果找其对应的靶基因可以通过miRWalk数据

回答于 2019-03-07 16:23

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便捷ID转化工具已经用不了了,显示数据错误,是为什么

很大概率是你的数据导入问题,导入表达谱数据,第一列是需要转换的ID,接下来每一列是代表一个样本

回答于 2019-03-07 16:14

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TCGA胃癌甲基化数据下载很长时间下载进度是0,是什么原因呢?

首先甲基化数据比较大,本身下载就会比较慢;然后你这种情况应该是网络问题,换个网络

回答于 2019-02-22 16:41

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RRA运行后报错,提示系统找不到指定的文件,RobustRankAggreg怎...

https://shengxin.ren/question/1312,看下这个喽

回答于 2019-02-22 16:40

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聚类热图绘制工具不能正常使用!显示正在绘图... 就没动过!

文件不对吧,你的这个里面给的是表达谱数据吗?

回答于 2019-02-14 08:59

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我使用的是TCGA的数据矩阵,为什么数据标准化工具里不能使用TPM...

数据处理顺序不对,1、TCGA下载工具下载合并数据;2、数据标准化工具转TPM;3、ID转换。如果先转换ID就无法转换TPM。

回答于 2019-01-28 09:36

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DECenter里出现NA counts not allowed是什么意思

数据类型不对,edgR需要给的counts数据,最直接检验方法看下数据是否全为整数

回答于 2019-01-22 09:19

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昨天开始,TCGA简易下载工具双击选择数据集后 一直显示正在检索...

换个网络试下,我这边测试没有问题

回答于 2019-01-22 09:17

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fpkm数据能用生信人自带的工具里的limma包分析么

可以的,如果是TCGA数据也可以用简易标准化工具转成TPM,不是TCGA的数据这个就不能转了

回答于 2019-01-21 11:56