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510 个回答

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怎么从TCGA中提取mRNA和micRNA数据

你的这个是拷贝数数据的结果，mRNA数据下载转录组的然后根据ID转换器提取mRNA，miRNA可以通过下载工具直接下载isform就可以用来分析了

回答于 2019-01-02 14:10

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TCGA数据中的很多样本数据缺失，显示为NaN，在做热图或者计算相...

计算相关性时候把这些又NA的样本剔除

回答于 2019-01-02 14:02

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GSEA 工具 运行出错

是不是背景文件和表达谱没有一一对应上

回答于 2019-01-02 14:00

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GEO数据标准化

下载原始cel文件，然后通过RMA对原始数据进行标准化，然后根据处理后得数据进行取log或者分位数标准化等

回答于 2019-01-02 13:56

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一键式WGCNA怎么启动？

视频版块又一个配置教程，可以学习下

回答于 2019-01-02 13:53

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DEC运行出错，请检查日志和数据，这是什么问题

这个分组名称简单点，尽量避免特殊字符出现

回答于 2018-12-26 13:41

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WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试！

尽量别有中文字符哦

回答于 2018-12-26 13:38

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boxplot运行成功后只有txt,没有图片

看下相似问题，能不能帮你搞定

回答于 2018-12-26 13:36

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TCGA seq数据6万多个基因位点ID转完后只剩1万多个，丢失了很多...

首先你要先搞清楚TCGA数据的6w多个ENSGid是包含编码基因、非编码、假基因等，编码基因只有1w多

回答于 2018-12-26 13:34

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用r语言分析的时候提示缺少cdf环境

这个你尝试用工具盒里面的RMA工具呢，不过需要你自己找到对应的cdf文件，这个从Affymetrix官网可以找到

回答于 2018-12-20 10:44