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510 个回答

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工具盒中使用DECenter时报错

你的这个分组信息给的有问题,肿瘤和正常组织分组名称要一样,不要后面带上编号,这样软件认为是单独的一个样本,而不是两组样本

回答于 2018-10-29 08:39

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TCGA简易下载功能 本地无法连接TCGA

你换个网络试试,刚才我试了可以的,然后现在最新版本是v14,看下你的是最新版本不

回答于 2018-10-29 08:38

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使用RMA导入数据时,出现问题

全部关掉重新启动试试看

回答于 2018-10-29 08:29

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登录不上

这个版本半年前就不更新了,用新版的工具盒

回答于 2018-10-26 14:45

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TCGA简易下载工具的临床随访数据中Clinical BCR Biotab,Clinical...

这个临床数据对应的样本而不是对应的组织部位,所以是不分癌与癌旁。

回答于 2018-10-26 10:03

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GEO数据库RNA测序数据分析

下载miniml数据可以用便捷GEO转换器提取样本信息和表达矩阵,然后在进行差异、火山图什么的

回答于 2018-10-26 09:59

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乳腺癌RNA-seq差异基因分析需要先排除基线(如年龄等)的影响吗...

这个看你个人分析需求,正常样本的临床信息是没有的吧

回答于 2018-10-26 09:37

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求WGCNA一键式软件发我一份

找到工具盒目录,点开source -> softs 在这个文件夹下面点开看哪个是WGCNA的

回答于 2018-10-26 09:35

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DECenter运行报错什么原因

看下表达矩阵里面是不是NA比较多,而且 正常样本数量是不是个数很少。

回答于 2018-10-25 09:12

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DECenter差异分析

这个你首先拍下顺序,如果你的这个是已经排好顺序,那结果就是Normal VS Turmol

回答于 2018-10-24 17:00