在导入数据的那个目录里面,按照时间排下序,找到最新的就成了
回答于 2018-11-09 15:18
从这提示来看是表达谱矩阵中的样本ID和样本文件中的样本ID有140多个没有匹配上
回答于 2018-11-08 15:28
额,GEO数据转换工具只是一个提取数据的工具,它并不能计算p值,计算差异p值需要用DEcenter软件
回答于 2018-11-08 15:23
http://sangerbox.com/请用最新版本的工具盒
回答于 2018-11-08 15:22
https://shengxin.ren/article/88按照这个文章学习下呢
回答于 2018-11-05 09:40
可以,只要输入数据是counts或FPKM或标准化后的都可以
回答于 2018-11-05 09:38
首先确定你找的GEO数据时候有生存数据,然后做批量生存时候的生存时间和生存状态要选择正确
回答于 2018-11-05 09:36
你可以尝试重注释,或者提取出GB_list转成gene symbol
回答于 2018-11-05 09:33
说明正常组织和癌组织在这些基因的表达上有差异;这个就是涉及建模的问题了,你可以从这些差异基因中挑选出最具代表性的一些,通过这些基因的表达情况来做预判
回答于 2018-11-02 11:15
对的,社区有一个临床随访信息表,你可以参考下那个文件
回答于 2018-11-02 11:10