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510 个回答

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sanger box 做WGCNA,为什么不成功,哪里出了问题?

从报错来看是表达矩阵的数据类型不对,你重新保存一份数据看看,用execel另存为文本文件(Tab分割)

回答于 2018-11-02 11:07

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TCGA中 27K的甲基化数据在R中做差异分析用什么方法进行筛选?十...

T检验,把阈值稍微放宽松一些

回答于 2018-11-02 11:05

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DECenter启动问题

https://shengxin.ren/sxrpost/wxpayGet?sid=139看下这个教程

回答于 2018-11-02 11:04

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您好。GEO便捷转换器等,点击“点击启动”,没有出现窗口,这是什...

https://shengxin.ren/sxrpost/wxpayGet?sid=139

回答于 2018-10-30 09:30

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便捷ID转换器V3,按照说明提取lncRNA,不成功

这个背景文件是你自己提供的他跟软件自带的背景文件格式不同,软件就不能识别这个类型属于mRNA或lncRNA,需要将背景处理成只含有lncRNA的格式,去除mRNA、假基因等其他类型,这样转换出来的就全都是lncRNA。

回答于 2018-10-30 09:29

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BOX里的GEO便捷转换器无法启动!

看下工具盒的配置教程

回答于 2018-10-29 13:16

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TCGA简易下载工具的临床随访数据中Clinical BCR Biotab,Clinical...

旧版的TCGA提供Biotab命名的临床信息,每种临床信息,会有一个单独的文件;新版的TCGA提供XML文件的临床信息,每个患者都有一个单独的文件;OMF XML不太清楚干嘛的;你下载XML的即可

回答于 2018-10-29 11:42

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一个探针对应多个基因??

这种情况一个探针对应多个基因是需要删掉

回答于 2018-10-29 11:36

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箱线图的制作

这个是工具盒配置出现异常,你可以看下配置教程https://shengxin.ren/sxrpost/wxpayGet?sid=139

回答于 2018-10-29 09:08

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请教GEO数据里面有负数,怎么处理?

这个你看下数据他给的这个数据是通过什么方法处理的,除非没得选择,不然我不太会用这种数据分析

回答于 2018-10-29 09:02