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如何区分下载的TCGA数据是癌组织还是正常组织?

https://shengxin.ren/question/1383之前有人问过同样问题,参看下

回答于 2018-08-22 20:51

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R读入数据 自动将-转成.,要怎么保持他们不变呢

这个又另外一个的一个处理办法,使用gsub将"."替换成“-”

回答于 2018-08-20 10:53

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登录sangerbox后打开内部工具显示启动成功,就是看不到界面

这个是jre没有配置好,有完整版的盒子你可以尝试用一下,如果还是不可以再盒子解压目录下有个config文件删除掉,应该就可以了。

回答于 2018-08-15 16:46

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批量生存分析做出来p值很小 但是下方的生存曲线却看不出差别

这个P值做的事单因素分析得到的结果用的是survival包,K-M生存曲线里面算到的logrank P值的计算方法跟单因素得到的P值没有什么关系,计算方法不同二者不能混为一谈。我之前也遇到过跟你类似得情况,单因素P值显著,但是生存曲线分不开,只好过滤掉了。

回答于 2018-08-15 16:44

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谁能给我一份,从下载TCGA数据开始,到数据整理完毕的,软件使用...

这个一般文章里面都有说明,你可以多找几篇文章看看

回答于 2018-08-09 08:49

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Sangerbox选择Rscript后闪退,求解答!

点到升级界面,配置好R后,关闭重新启动盒子,就可以用了

回答于 2018-08-08 13:13

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如何用BLASTP测大白菜和拟南芥的基因共线

1、拿这些蛋白做一个blast比对 2、找出这些基因的GFF文件,按照MCscan软件的格式提取 3、用MCscan分析共线性

回答于 2018-08-07 08:58

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cluster3.0闪退,是数据不对齐所致吗?

你的这个数据有多大,怀疑是电脑内存不足,导致的闪退;可以换一个小的数据集测试下能否运行

回答于 2018-08-07 08:55

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特定基因与生存关系

1、导出结果 2、excel打开结果文件找到你关注基因 3、回到分析界面,根据excel定位,再去查找能快一点 目前没有这种检索的功能

回答于 2018-08-07 08:54