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510 个回答

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工具盒提示已启动但是没操作界面

在升级界面安装盒子内置Java

回答于 2018-08-07 08:50

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老师您好,生信人VPN定制化客户端,点启动软件之后,没有跳出来...

https://shengxin.ren/article/364参考这个配置下,没有弹框出来是因为JRE版本要在1.8.0以上

回答于 2018-08-05 15:27

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有人做过生存分析吗?

你好,可以在社区搜索生存分析->选择‘文章’会有意外收获,比如https://shengxin.ren/article/151,https://shengxin.ren/article/144,https://shengxin.ren/article/203

回答于 2018-08-05 10:35

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DE center里运行DESeq2做分析的时候,提示“不存在叫'DESeq2'这个...

有人遇到同样的问题https://shengxin.ren/question/868参考下是否与你的情况相似; 也可以参考sangerbox配置方法https://shengxin.ren/article/364,看看能不能解决

回答于 2018-08-05 10:31

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GEO通过R语音分析产生差异序列分析DEG.TXT,接下来如何做heatmap...

1、根据DEG.TXT的差异基因ID提取表达谱数据,通过pheatmap包就可以做出来,想优化聚类图可以参考https://shengxin.ren/article/107; 2、第二种方法用SangerBox中的DEcenter进行差异分析,选择好差异分析方法;然后通过DEcenter的分析结果通过热图和火山图工具来进行作图

回答于 2018-08-05 10:26

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TCGA简易下载工具合并文件问题

TCGA最近更新了,临床信息有Biotab、XML和OMF XML三种,选择XML下载,然后在进行合并。

回答于 2018-08-02 11:16

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急啊,从GEO下载的series_matrix文件,解压之后得到TXT,3.95G,...

上传到服务器上打开,windows打开比较费劲,可以尝试用Editplus打开

回答于 2018-08-02 10:01

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R语言作图

这种图我也不知道叫啥,如果不行可以拆解一下,每一部分单独画出来,然后通过AI把它们合并到一起

回答于 2018-08-02 09:57

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geo数据fc怎么算,下载后的fc是已经去过log2的么。deenter的结果...

这里的fc是指fold change么?第一个问题楼上已经回答,第二个问题DEcenter里面取的是log2FC

回答于 2018-07-31 21:21

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小工具分析的结果能写文章的时候怎么写

工具没有文章可引用,这里只能说下使用的方法和参数

回答于 2018-07-31 21:19