在用limma做差异分析时建立线性模型失败报错Error in rowMeans(y$exprs, na.rm = TRUE) : 'x' must be numeric

1）在用limma做差异分析时建立线性模型失败报错Error in rowMeans(y$exprs, na.rm = TRUE) : 'x' must be numeric

2）样本按照前45con后45case处理过如下

按照视屏操作前面运行顺利但在

fit <- lmFit(exp, design) 运行时出现错误查找类似问题很少出现，有一个是第一列重复造成的，但是我的矩阵表格中并没有重复列，实在是很伤脑筋，望大神指点。

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2 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师 2018-08-12 19:43

你这个应该是读入的矩阵中存在非数字的值，你检查一下数据

另外：买了视频直接问视频方，知其然，知其所以然

yuzhimin 2020-03-14 23:40

我遇到了同样的问题，需要你把基因名转换成行名，让第一列保持为数字型数据，就可以继续了。