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5 GEO数据提取

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GEO数据分组

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TCGA简易小工具下载的合并数据可以直接用Graphpad分析不用R语言吗

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TCGA 配对样本

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老师，想问下怎么将RNA-seq中的ensemble ID转化成基因名字啊？搞了半天没找到。。。。

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3 不同方式下载的TCGA数据出入较大

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不同方式下载的TCGA数据出入较大

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cytoscape做蛋白相互关系时输入基因有数量要求吗

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cytoscape做蛋白相互关系总做不出来，系统总崩怎么回事呢

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10 count数据做差异分析的时候，利用盒子edgeR或者DESeq2方法进行分析。edgeR获取的差异基因（FC 1和FDR0.05）对比别人用R包直接编程的总少很多。

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RNA-Seq数据进行ID转化，许多基因转不出来，用以前的版本是可以做出来的，是版本的问题还是矩阵处理有问题

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如何从OMIM数据库下载disease和gene关系

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使用BWA，如何计算unique mapping reads

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老师请问，TCGA中食管癌数据食管鳞癌代码是什么，腺癌是什么，谢谢啦

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老师请问，TCGA中食管癌数据食管鳞癌代码是什么，腺癌是什么，谢谢啦

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老师请问，TCGA中食管癌数据食管鳞癌代码是什么，腺癌是什么，谢谢啦

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老师，您好，tcga lihc id转换开始分析用的是旧版的，得到24000左右的基因然后分析投稿被修回；试用新版的取蛋白编码基因只得到19000多。旧版的可以使用吗？差了几千个基因差别是在哪里呢？

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3 老师你好！我想用tcga mRNA数据估算肿瘤微环境中细胞相对含量，比如通过CIBERSORT、MCPcounter等工具进行转换，输入矩阵用counts，FPKM还是TPM数据啊？

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选择原文一样的条件，做不出DEG

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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