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5 TCGA下载工具下载的表达数据样本有后边跟着REP编号的，请问这是什么（不同阶段？重复试验？），应该怎么处理（删去？取均值？）？

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De-center界面是logFC和FDR，没有P值

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3 GSE17328转换出的矩阵文件ID-REF不是gene

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3 基因名变换时R代码的问题

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  • GOCE 2018-01-04 22:01

DE center最后总是运行出错，原因如图

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3 关于简易tcga下载工具合并后的gene count

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3 老师们，GEO数据转换器里ID没有gene symbol

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关于TCGA下载工具lncRNA的count和fpkm

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  • Pham 2018-01-03 00:33

用De-center分析GEO数据，结果excel中没有差异基因解决方法？

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10 DEcenter 差异分析时总是提示错误

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  • Pham 2018-01-02 05:30

DE Centre V5分析基因芯片时出错

1 回答

祝老师请教一个问题，火山图的横纵坐标虚线值是多少？

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TCGA简易数据库转换的时候，是ENSG_ID最后一位要加上1再去biomart转换？如：ENSG00000111224.12转换为gene名的时候将ENSG00000111224.12变为ENSG00000111224.13才转换，只有这样才能得到工具转换出来的结果，为什么加上1呢？

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用工具盒里的DECenter做差异分析的时候矩阵显示不全

1 回答

为什么TCGA简易数据库ENSG_ID转换得到的基因数和在Ensembl转换得到的数量不一样？

1 回答

求教工具盒V7里面没有TCGA_ID转换器？这个怎么解决？

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TCGA RNASeq数据归一化FPKM数据可否使用Z-Score归一化

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想问问TCGA简易下载工具的SNV只有Muse和VarSan2?

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10 登陆失败

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5 登录失败

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