TCGA小工具下载的RNA表达FPKM矩阵，可否直接用于下游分析？还需校正吗？
请问我从TCGA下载FRPM表达量数据的时候，中途由于网速很慢中断了下载，重新开始下载的时候，我手动找到上次下载的进度，接着下载余下的数据，最后会不会生成log文件，如果能的话，log文件是全部的数据吗？请老师解答，谢...
TCGA简易小工具下载完癌和癌旁所有转录组Counts数据，想做某个基因在癌和癌旁表达量的差异分析，但是下完是这种的，请问接下来我该怎么办
TCGA的matrix.txt里面首列是EN开头的基因编码怎么转换成基因呢 谢谢
文献为：TANRIC: An interactive open platform to explore the function of lncRNAs in cancer 发表在：Cancer Res. 2015 September 15 截图：
在tcga下载了rnaseq后，合并得到genecount，我经过id转换之后得到很多LNC或LOC开头的id名，在GEPIA里面查询不到这些基因的信息，全网搜索有些没结果有些则是mirna，而且这部分基因占比不小，我做了WGCNA之后模块里面也出现这些id，...
...们，本人刚刚接触生信，想咨询一个可能很弱智的问题，tcga如何下载某一特定类型的肿瘤数据，我想下载一下口腔癌或者舌癌的数据，但是里面搜到的数据是头颈鳞癌，打开clinical数据不知如何筛选，，查到的数据BA，BB不知道...
利用生信人 简易工具下载了某肿瘤 癌和癌旁（或者原发和转移） mRNA seq和患者clinical的数据，然后合并，我们都知道，并不是每一例患者都有临床数据，这样，两者的例数就不相等，此外，也有可能是某些样本做了重复，导致se...
最近下载了肺癌的某编码基因的表达数据，但是发现数据有若干离群值（表达量非常之低），对整体数据影响很大，作图很丑，请问可以删去这些值么？？？这样做属于篡改数据么？
使用简易TCGA下载工具V8下载RNA_seq数据，合并后，进行ENSG_ID转换，产生两个文件Merge_matrix.txt.cv.lnc ，Merge_matrix.txt.cv ，请问分别包含什么类型RNA，Merge_matrix.txt.cv.lnc 是 仅含有lncRNA么，Merge_matrix.txt.cv是仅含有mRNA么。请指点，谢谢...