我从Broad institute上分别下载了miRNA数据和临床相关数据两个txt文件,首先我利用R包对miRNA分析后得到了一百多种差异表达miRNA,现在想提取病人基本的临床信息,以行生存分析和相关分析检测,但是前面下载的临床数据文件内容...
为什么已下载生信人VPN定制化客户端,但是打不开Google,也获取不了远程TCGA项目列表信息呢?
我参照这篇文章(https://shengxin.ren/article/208)下载肝癌的RNA-Seq数据时有一些问题想请教一下 1.这个下拉菜单栏里面有好几个选项,请问有什么区别吗? 2.我选择了HTSeq-count(424)下载后,发现里面全是压缩包格式的文件,然后我通...
,有些值不是整数是神马意思 谢谢!!!
如题。。。到底是抑癌还是促癌呢?
如题
1.下载STAD数据中BCGSC miRNA profiling(491),下载成功,并能完成合并;打开merge文件,发现错位,数值矩阵和标题(样本名)错两列; 2. 其中一列数据全部为N; 3. 寻找下载的每个样本的独立文件,发现前两列也有错误,是其中...
... (MD5)illuminahiseq_rnaseqv2-RSEM_genes_normalized (MD5) firebrowse中TCGA数据下载文件名的意义?我们平常来分析常用哪种?我查阅了RSEM是计算counts的一种方法,而好多教程都是要求FPKM来计算,如何转换?又有资料说用RSEM的counts来计算FPKM...
TCGA简易小工具合并后查到的ENSG格式的名字对应的Counts的数据请问可以使用做差异分析吗比如第一个ENSG,上面对应的TCGA-AA-A00Q-01对应的值4406是不是就是该患者癌组织该基因的Count值,可以拿来直接做差异分析吗