请问有没有有权限下载TCGA上的bam和vcf数据的人？我申请了以后一直没有消息，求帮助。
用TCGA数据归一化工具，进行FPKM矩阵的转换时，所有的样本进度一直停留在0%，是不是这个工具不能一次处理很多个数据？
请问如何用TCGA中数据来验证胶质瘤的MGMT启动子甲基化与预后的关系？求老师们指点～
如题，在TCGA中的并没有找到pan-cancers的下载链接
我用TCGA简易下载工具下载胃癌临床（clinical）数据，帖子说有156项，我下载之后再解析却只有20来项，加上biospecimen也远远没有156项，我很疑惑，求解
使用TCGA简易下载工具下载的TCGA表达谱数据，想要移除表达谱的批次效应，应该要怎么做呢？ 当然，有sva包可以实现，但是需要不同样本的batch的信息，这个batch信息怎么获取到呢？ 临床信息中并没有这个信息。 求大神指点！
老师您好，请问TCGA上基因的表达使用的是FPKM。怎么样转换GEO芯片的表达单位，使两者可以同时比较？谢谢老师
求一份TCGA简易下载工具或者下载链接
请问老师，利用小工具自TCGA下载的miRNA表达值数据很多为0，不知是不是测得的实际数值为0，还是没有检测该miRNA数据，NA的意思？
最近在做TCGA数据库的数据挖掘，想请问一下，TCGA的临床信息中哪里能找到肿瘤临床分期信息（也就是grade分期）？谢谢
今天发现TCGA简易下载工具有个问题，里面也可以收到GEO数据库的文件，可以合并文件，但是如果下载TCGA数据库的文件合并临床信息的时候均无法合并成功，一直显示正在合并，而实际文本大小为0kb.
从v9.1下载的甲基化数据为txt格式。合并文件是只能用json格式？请问该如何解决？
由于刚刚接触TCGA数据库，麻烦大家多多指教