利用生信人 简易工具下载了某肿瘤 癌和癌旁（或者原发和转移） mRNA seq和患者clinical的数据，然后合并，我们都知道，并不是每一例患者都有临床数据，这样，两者的例数就不相等，此外，也有可能是某些样本做了重复，导致se...
最近下载了肺癌的某编码基因的表达数据，但是发现数据有若干离群值（表达量非常之低），对整体数据影响很大，作图很丑，请问可以删去这些值么？？？这样做属于篡改数据么？
V14小工具的列表里面找半天没找到呢
...预后相关的biomarker。我们曾介绍了一个癌症相关的数据库TCGA，其中含有33多种癌症，11000多个病例，包含多组学数据和临床数据。今天就跟大家介绍一篇发表在Gynecologic Oncology(IF:4.95)上的挖掘TCGA数据的文章“A 15-long non-coding RNA sig...
老师，您好，我想请您指导一下，tcga的临床资料中，表示患者随访结束后最终生存状态的是还是？
生信人工具盒里的TCGA下载小工具里下载的临床数据GSE编号是多少可以知道吗？
请问如何将TCGA某一肿瘤数据按照高氧化磷酸化和低氧化磷酸化将每个样本分类？
能否用TCGA中GBM的正常样本和LGG的肿瘤样本合并在一起，然后做差异分析呢？ 因为TCGA数据库中GBM（胶质母细胞瘤）数据中有5个正常样本，而在LGG（低级别胶质瘤）中却没有肿瘤样本。GBM与LGG都是脑的原发肿瘤，只是级别的差...
生信小白，对于所谓的标准化数据不太懂，希望大牛们指导。。。
老师你好，tcga批量生存时间计算，表达数据归一化后值比较大的指标，比如都是几十几百的，最后都算不出生存曲线，但是之平均在20以下的，都可以算出来，这是为啥
结果为图1，导出为图2，matrix文件用Excel打开后如图3。为什么图3中的表格不是图1 中的resultview表格呢？求问，谢谢祝老师。
..."生信学霸"添加关注，我们一起进步 “为了解决在使用TCGA数据做数据分析时各种数据转化问题，话不多说直接看教程，干货满满” 01 — 研究背景 前段时间，小编给小伙伴们系统的介绍了转录组分析过程中的常用数...
我用TCGA简易下载工具下载了肝癌的microRNA数据，包括正常组织和原发肿瘤两份数据。下载文件合并以后，将得到的数据复制粘贴到EXCEL表格中，把两份数据的两列microRNA名字进行比对，发现有个别microRNA错位，导致两份数据无法进...
用DECenter分析TCGA里的miRNA数据时报错 some values in assay are not integers ，请问怎么解决呢？