请问TCGA中的level1数据和level3数据的样本数量是否一致？十分感谢

请问Sanger box里下载的基因表达和临床数据是从TCGA官网下载的吗？

TCGA RNASeq数据归一化工具使用例子

... 最后等待转换完成 例子2： 已有数据矩阵，比如已有TCGA简易下载工具处理合并后的数据矩阵：Merge_matrix.txt 打开软件：点击“选择矩阵”按钮，选择Merge_matrix.txt文件 最终软件将矩阵表格中各样本的数据解析之后列出来，我...

用TCGA数据不用编程轻轻松松构建CeRNA网络

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类，想必大家已经对它并不陌生，特别是做肿瘤方向。 CeRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编...

TCGA小工具安装v8的时候提示这个错误，有什么解决办法吗？

双击main.exe之后，提示这个错误，有什么解决办法吗？本人电脑是win7 ，64位的。我想用的是CNV的数据对应样本，貌似只有V8可以，在main.exe.log中改什么能正常使用呢？

TCGA胃癌生存分析点批量运行后，结果为啥一直出不来（已把缺失值删除）

已计算结果一直卡2585 已解决：运行的时候把工具盒这个软件界面给关掉就好了

TCGA批量生存分析工具如何将所有基因生存曲线批量导出到PDF文件里

 这个批量生存分析工具结果只能挨个点击想看的基因的曲线图，有没有一次性导出所有基因曲线图的功能？

如何用TCGA下载小工具merge以后得到RPKM而不是counts的合并数据？

真的小工具下载下来的mRNA合并，如何得到RPKM的合并数据而不是counts的合并数据？

解决 用简易TCGA下载工具，clinicalFull出错，显示“合并提取所有临床随访信息出现错误，请检查文件”

这种错误怎么处理啊？求助，感谢

TCGA简易下载工具V16中的临床随访信息中各项如何解释？

老师，V16版中的临床随访信息，比如像NEW EVENT和NEW EVENT TIME，在购买您的临床信息解释中没有找到具体对应项，请问有V16版的临床解释吗？

两种TCGA数据 RNAseq - HTSeq（Counts）和RNAseq - IlluminaHiSeq（RSEM）的区别

在https://xenabrowser.net/中我发现了两种格式不太一样的TCGA数据 以luad数据集举例 第一种是 dataset: gene expression RNAseq - HTSeq - Counts 这个有60,484行，每一行似乎是一个ENSG基因编码，是count数据，类似的还有FPKM和FPKM-UQ 另外一种是 d...

简易TCGA下载工具，运行报错

raceback (most recent call last):   File "Main.py", line 21, in   File "com\sxr\utils\FileOpertor.pyc", line 11, in   File "xmlrpclib.pyc", line 145, in   File "httplib.pyc", line 80, in   File "mimetools.pyc", line 6, in   File "tempfile.pyc", line 35, in   File "random.pyc", li...

tcga下载后的文件进行edger和heatmaps分析

老师您好，从小工具下载了 merge_matrix. txt文件merge_matrix. txt.cv文件，clinical full.matrix.txt文件。之后进行edger分析。请问是用第一个文件么? 运行时显示各种找不到对象，是因为merge_matrix. txt文件打开excel后的表头等参数和找的代码...

firebrowse中TCGA数据下载文件名的意义？

... (MD5)illuminahiseq_rnaseqv2-RSEM_genes_normalized  (MD5) firebrowse中TCGA数据下载文件名的意义？我们平常来分析常用哪种？我查阅了RSEM是计算counts的一种方法，而好多教程都是要求FPKM来计算，如何转换？又有资料说用RSEM的counts来计算FPKM...

拿TCGA肝癌的RNA-Seq数据来做差异分析例子

...做差异的例子如：https://www.shengxin.ren/article/207 这次来用TCGA的肝癌的数据来演示以下，我们选择大家比较喜欢的RNA-Seq Counts数据 使用TCGA简易下载工具选择肝癌RNA-Seq Counts数据进行下载如： 下载完成后我们共得到421个样本数据如...