TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。
TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类，想必大家已经对它并不陌生，特别是做肿瘤方向。
CeRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。
本期视频介绍通过TCGA数据不用编程构建CeRNA网络。
首先，这个绝对是新收的福利，主讲老师非常细致讲解TCGA上面的数据类型，可谓是多年的经验总结。
一、数据挖掘系列之二之如何构建CeRNA网络
TCGA数据讲解完毕，那么接下来就是对本次课程需要用到的数据准备工作，也就是预处理的过程。
二、CeRNA网络构建—数据预处理
数据已经准备完毕，mRNA、lncRNA、miRNA这么多全部用来分析很不现实，那么针对不同的RNA-Seq数据类型使用怎么样阈值和统计学方向筛查差异降维
三、CeRNA网络构建—不同类型RNA数据的差异基因筛选
mRNA、lncRNA、miRNA经过差异分析降维后，miRNA与mRNA二元关系，miRNA与lncRNA二元关系以及mRNA-miRNA-lncRNA的三元关系筛选的方法
四、CeRNA网络构建—miRNA与mRNA互作关系
五、CeRNA网络构建—miRNA与lncRNA互作关系
我们的三元网络已经构建完毕，这个节点密密麻麻太多，进一步分析降低节点方式，更为一目了然的挑选关键lncRNA、mRNA和miRNA
第一种方法是保留mRNA、lncRNA与miRNA均呈现负相关的关系对
六、CeRNA网络构建—相关性方式优化
第二种方法是通过筛选与生存相关的lncRNA、mRNA、miRNA根据这些进行网络构建，并通过MRE算法进行优化
七、CeRNA网络构建—生存分析和MRE优化
到此为止，本次GEO数据数据挖掘系列之一已完结
各位看官们儿，敬请期待我们下期视频《零代码教你分析WGCNA》！！！
喜欢的别忘记点赞哦！！！
