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请问用TCGA数据库简易工具下载数据和做生存分析,写文章在方法学部分该怎么描述?

SangerBox下载的工具保存在哪个目录下,比如下载的“TCGA简易下载工具”在哪个文件夹下啊,谢谢~

新版TCGA中表达数据下载后有6万多个ENSG号,其中包含了lncRNA,如何提取lncRNA的表达数据

如题

GSEA分析

您好!我在用简易GSEA分析工具分析TCGA数据来源时,导入TCGA基因表达谱数据后,选择某个基因高低表达(前后各25%),然后点击批量运行,提示:读取表达谱文件错误,请检查文件,难道是因为TCGA表达谱数据数值过大?

在做TCGA-STAD 的 RNA-seq 差异分析的时候出现了这样一个问题

实在是搞不懂了呀,不少人说是数据问题,可是我在用EXCEL查找,- . NA none 都没有查找到 您遇到过这样的问题吗 我实在是找不到解决的方式,请求老师帮忙。

关于TCGA下载工具lncRNA的count和fpkm

我在生信人工具下载了rna-count和rna-fpkm的文件,各自合并文件之后转换基因名,得到全基因、lncrna、mrna的count矩阵和全基因的fpkm矩阵,可是我想要lncrna的fpkm值,通过匹配处理之后发现一万五的lncrna count的基因名在全基因的fpkm只...

TCGA下载小工具v16可以合并miRNA profiling下载后的txt文件么

下载了胃癌的miRNA profiling 的txt文件,想请问一下下载小工具v16版本可以将txt文件合并么,下面的文件类型没有txt类型>﹏< 想请问老师怎样可以将miRNA profiling下载下来的文件进行整合合并处理得到RPM值啊<(_ _)>

请问一下TCGA下载工具提取出的临床数据哪个可以看是否做过根治性手术

breast_carcinoma_primary_surgical_procedure_name breast_carcinoma_surgical_procedure_name 是有什么区别呢?

解决 请问下载的TCGA 甲基化数据如何表示某个基因的甲基化水平呀,是该基因所有位点Beta值的均值吗?

向各位大神请教TCGA样本数据库里有DMFS的信息如何找到,我只找到了OS和RFS?谢谢

解决 关于TCGA下载工具里的ENSG-ID转换,请问只能自己一个个的选中转换么?不能批量转换么?

能不能把TCGA病理临床资料详细解读发我一份?临床的搞科研不容易啊,谢谢670368358@qq.com

TCGA 下在某一癌型的甲基化数据(450K 平台),如何判断、筛选那些是启动子区域的甲基化位点哈……

手把手教你从TCGA乳腺癌的表达谱样本中提取出三阴性的样本的表达矩阵

...么搞到三阴性乳腺癌的表达谱数据,故有此文 首先使用TCGA简易下载工具下载乳腺癌的表达谱和临床随访信息。 问句1: 这是他的临床数据: ER PR在临床随访信息中很好找,但是HER不好找 回答如下: her 看这三列,前两...

解决 大家好,V6版简易下载工具下载不了AML和LAML的RNASeq的数据,但是TCGA官网可以下载

如题