手把手教你从TCGA乳腺癌的表达谱样本中提取出三阴性的样本的表达矩阵

刚好在做课件是有同学问怎么搞到三阴性乳腺癌的表达谱数据,故有此文 首先使用TCGA简易下载工具下载乳腺癌的表达谱和临床随访信息。 问句1: 这是他的临床数据: ER PR在临床随访信息中...

刚好在做课件是有同学问怎么搞到三阴性乳腺癌的表达谱数据,故有此文

首先使用TCGA简易下载工具下载乳腺癌的表达谱和临床随访信息。

问句1:

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这是他的临床数据:

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ER PR在临床随访信息中很好找,但是HER不好找

回答如下:

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her 看这三列,前两列是 两种检测 方法,第三列 是 综合考虑的结果,你需要 结合这三列的信息 自己在归纳一下

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大图如,已经把表达谱导入进去了

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attachments-2018-08-s8Ae7eqF5b7c17dc072d3.pngattachments-2018-08-zg8MyefK5b7c17f87dff2.pngattachments-2018-08-pUmHWJmL5b7c18a77aa34.pngattachments-2018-08-igopkjmR5b7c18b8450f7.pngattachments-2018-08-LjT3PRav5b7c192b97c51.png大图如:

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更详细的步骤如:https://shengxin.ren/article/420




  • 发表于 2018-08-21 22:02
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  • 分类:软件工具

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