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变量处理：要实现pipeline图形设计器，首先要先对用到的变量，做统一的设计分析步骤/节点设计：前文提到，生信分析pipeline其实就是基于文件输入输出的工作流，这里对工作流做了简化，归纳起来工作流中有4种节点。工作流设计：最后，有了变量，和节点，最后就是工作流的设计了。用连接线，将以上4中节点连接起来，计算相互之间的依赖关系，用统一的格式保存起来。

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豆浆包子发布于 2019-09-19 13:23

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生信分析云平台产品开发 - 3 生信分析pipeline的进化

接上两篇内容，本文主要讲述工作中NGS从科研进入医学临床领域，工作中接触到生信流程，以及最终在自动图形化开放式生信分析系统开发中生信workflow设计实现的过程。 1.手动命令行运行 2. 脚本连续运行 3.一个脚本 shell 文件运行整个分析流程 4. 自动扫描文件并运行脚本 5. 带报告的自动扫描并触发运行脚本

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豆浆包子发布于 2019-09-09 18:19

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生信分析云平台产品开发 - 2样本信息处理

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豆浆包子发布于 2019-08-28 23:10

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生信分析云平台产品开发 - 1简单需求分析及技术实现

我的生信生产系统/全自动分析系统开发过程- 1简单需求分析及技术实现起因/背景几张图片实践问题一，图形化替代命令行脚本交互实践问题二，解决迁移部署问题实践问题三，解决环境搭建、软件安装问题需求：分析流程（pipeline）能够快速部署迁移技术实现：使用虚拟化技术：最终软件架构设计如图：自动运行结构如图（针对Illumina机型）：

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豆浆包子发布于 2019-08-21 17:19

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