FPKM - 生信人

FPKM

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寒玉 2019-01-19 16:43:44

fpkm数据能用生信人自带的工具里的limma包分析么

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cuiying 2018-11-26 10:35:02

请问利用TCGA的数据求两个基因的相关系数，应该用FPKM还是应该用TPM呢？

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cuiying 2018-11-26 10:32:45

请问TCGA的数据都是双端测序的吗？为何一些文章用了TCGA的表达数据计算出了RPKM，不是应该为FPKM吗？

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海拔 2018-07-13 10:54:44

您好，非常感谢您回答我提出的关于使用哪种RNA数据进行分析更好的问题，我想再请教一下：如果我进行癌和癌旁差异性基因的分析，那应该是用哪种数据合适呢？是cbioptotal处理后的rsem数据还是用TCGA简易下载工具下载的三种（ count，fpkm，fpkm-uq）中的哪种呢？

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Binke 2018-05-22 10:17:06

根据TCGA提供的RNA序列数据做预测的原理问题

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Star 2018-02-22 17:58:52

如果要比较T vs NT某基因表达量的差异，应该用FPKM还是FPKM-UQ

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李志标 2018-02-13 14:21:39

tcga下载的fpkm要用什么r包进行处理？

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挖挖 2017-11-23 21:06:08

FPKM多大才认为这个基因是表达的？

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lzzzzz123321 2017-08-03 18:54:19

Python处理如何将相同基因的FPKM算一个平均值再输出

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陈东君 2017-08-03 15:23:59

关于DESeq和edge R做差异表达的一些疑问