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关于测试数据共享文件声明 百度云是一种非常方便的文件共享方式,但是有时会出现文件无法通过审核,导致大家访问失败?之前团队分享视频(百度管片最严,你懂的,上周六的纪录片将扩展名mkv修改...
ggrepel解决标签之间重叠问题简介 有时样本比较多,而我们想在图形中添加标签的时候,容易出现标签遮盖的问题。 尤其是在扩增子研究中,在相同基因型、环境条件宿主(温室植物、饲养动物)至少...
基于16S OTU表预测细菌表型数据库,同时可进行组间差异分析 BugBase Predicts Organism Level Microbiome Phenotypes Tonya Ward, Jake Larson, Jeremy Meulemans, Ben Hillmann, Joshua Lynch...
本系统文章叫分析解读,即有详细的扩增子分析流程代码,又有本人对使用参数、备选参数意义的解读,可以让大部分人零基础学习并理解数据分析过程,并可亲自实践在自己的课题上,获得更好、更合理的实验结果。
研究基因功能的人建个树,需要找近缘物种、外类群十几至几十个物种,费N天的劲才能做个树。而宏基因组领域的人不用去收集其它物种,因为研究的对像本身就有几百到几千的物种,为了方便阅读或展示主要信息,我们反而会挑选结果中前100以内的物种去分析并展示。这是我们绝对的优势。
本文内容首发植物微生物组公众号,更多阅读欢迎跳转植物微生物组公众号 MWAS简介 微生物组关联分析(Microbiome/Metagenome-wide association studies , MWAS)是指捕获多维尺度上的互作作用,...
本网对Markdown排版支持较差,请跳转植物微生物组公众号阅读 背景介绍 在近年来,随着宏基因组技术的发展,对原核生物的纯培养逐渐被忽视,但纯培养对于阐明这些微生物的功能是必需的。 本...
本文转载自“宏基因组”,更多文章跳转公众号阅读 宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强本领域的技术交流与传播,推动中国微生物组计划发展,中科院青年科研人员创立“...
本文中引用统计采用Google学术,统计日期截止2017年10月9日。 Usearch简介 主页:http://www.drive5.com/usearch/ Usearch是什么?它是超快的序列分析软件,在序列比对、聚类、操作等多领域...
宏基因组领域是当今热门领域,也正是方法快速发展和变革的时代。之前还把 97%聚类OTU作为扩增子行业的金标准。转眼间各位大佬纷纷向OTU聚类方法拍砖,都不建议再使用。 Feature代替OTU是趋势...