生存分析——在线工具
生存分析在线工具
生存分析除了采用R、SPSS等软件外，也可以应用在线工具
网址：http://kmplot.com/analysis/
下面简单介绍下这个在线工具KM plotter
打开界面：
KM plotter 应用一万余个癌症样本评估了五万多个基因对于生存的影响，其中样本来自于对乳腺癌、卵巢癌、肺癌、胃癌患者数十个月的随访，因此该网站可以进行乳腺癌、卵巢癌、肺癌、胃癌的mRNA表达和乳腺癌miRNA的预后分析。
下面以乳腺癌为例进行预后分析：
点第一个预选框进入breast canner的预后分析界面
1.输入Affy id 或者Gene symbol（例如：STAT2）
2.病人划分：中值、四分位值等（例如：median）
3.生存状态：RFS（无复发生存）、OS（总生存期）、DMFS（无病生存）、PFS（无进展生存）（例如RFS）
4.探针集合选项设置（例如：user selected probe set）
5.肿瘤分型设置
6.绘图
得到结果：
同理也可对其他癌症进行类似的预后分析并画出生存曲线
- 发表于 2017-08-28 20:11
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- 分类：方案研究
